Protein–RNA interactions for Protein: E0CXF8

BC035044, cDNA sequence BC035044, mousemouse

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Length 138 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035044E0CXF8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC035044E0CXF8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC035044E0CXF8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC035044E0CXF8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC035044E0CXF8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC035044E0CXF8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC035044E0CXF8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC035044E0CXF8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC035044E0CXF8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC035044E0CXF8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC035044E0CXF8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BC035044E0CXF8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC035044E0CXF8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC035044E0CXF8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC035044E0CXF8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC035044E0CXF8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC035044E0CXF8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC035044E0CXF8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC035044E0CXF8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC035044E0CXF8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC035044E0CXF8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC035044E0CXF8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC035044E0CXF8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC035044E0CXF8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC035044E0CXF8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC035044E0CXF8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC035044E0CXF8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC035044E0CXF8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC035044E0CXF8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC035044E0CXF8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC035044E0CXF8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC035044E0CXF8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC035044E0CXF8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BC035044E0CXF8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC035044E0CXF8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC035044E0CXF8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC035044E0CXF8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC035044E0CXF8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC035044E0CXF8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC035044E0CXF8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC035044E0CXF8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC035044E0CXF8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC035044E0CXF8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC035044E0CXF8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC035044E0CXF8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC035044E0CXF8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC035044E0CXF8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC035044E0CXF8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC035044E0CXF8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC035044E0CXF8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
BC035044E0CXF8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC035044E0CXF8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC035044E0CXF8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC035044E0CXF8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC035044E0CXF8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC035044E0CXF8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC035044E0CXF8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BC035044E0CXF8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BC035044E0CXF8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BC035044E0CXF8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BC035044E0CXF8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BC035044E0CXF8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BC035044E0CXF8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
BC035044E0CXF8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BC035044E0CXF8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BC035044E0CXF8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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BC035044E0CXF8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BC035044E0CXF8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC035044E0CXF8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC035044E0CXF8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC035044E0CXF8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC035044E0CXF8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC035044E0CXF8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC035044E0CXF8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC035044E0CXF8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC035044E0CXF8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC035044E0CXF8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC035044E0CXF8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC035044E0CXF8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC035044E0CXF8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC035044E0CXF8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
BC035044E0CXF8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC035044E0CXF8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC035044E0CXF8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC035044E0CXF8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC035044E0CXF8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC035044E0CXF8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC035044E0CXF8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC035044E0CXF8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC035044E0CXF8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC035044E0CXF8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC035044E0CXF8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC035044E0CXF8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC035044E0CXF8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC035044E0CXF8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC035044E0CXF8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC035044E0CXF8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BC035044E0CXF8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BC035044E0CXF8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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