Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Atp6ap1lD3Z5W0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms