Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc6D3YZP9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc6D3YZP9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
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