Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptprz1B9EKR1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptprz1B9EKR1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms