Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tmf1B9EKI3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmf1B9EKI3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms