Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzd8B9EJ80 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzd8B9EJ80 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzd8B9EJ80 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzd8B9EJ80 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd8B9EJ80 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd8B9EJ80 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd8B9EJ80 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd8B9EJ80 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd8B9EJ80 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd8B9EJ80 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd8B9EJ80 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd8B9EJ80 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd8B9EJ80 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd8B9EJ80 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd8B9EJ80 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd8B9EJ80 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd8B9EJ80 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd8B9EJ80 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd8B9EJ80 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd8B9EJ80 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd8B9EJ80 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd8B9EJ80 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd8B9EJ80 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd8B9EJ80 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd8B9EJ80 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd8B9EJ80 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd8B9EJ80 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd8B9EJ80 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd8B9EJ80 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd8B9EJ80 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd8B9EJ80 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd8B9EJ80 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd8B9EJ80 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd8B9EJ80 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd8B9EJ80 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd8B9EJ80 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd8B9EJ80 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd8B9EJ80 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd8B9EJ80 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd8B9EJ80 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd8B9EJ80 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd8B9EJ80 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd8B9EJ80 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd8B9EJ80 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd8B9EJ80 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd8B9EJ80 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd8B9EJ80 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd8B9EJ80 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd8B9EJ80 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd8B9EJ80 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd8B9EJ80 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd8B9EJ80 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd8B9EJ80 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd8B9EJ80 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd8B9EJ80 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd8B9EJ80 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd8B9EJ80 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pdzd8B9EJ80 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pdzd8B9EJ80 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pdzd8B9EJ80 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pdzd8B9EJ80 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pdzd8B9EJ80 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms