Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clip3B9EHT4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clip3B9EHT4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms