Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Apol7aB2RT54 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apol7aB2RT54 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms