Protein–RNA interactions for Protein: B2RS76

Cpb1, Carboxypeptidase B1 (Tissue), isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpb1B2RS76 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cpb1B2RS76 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cpb1B2RS76 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms