Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ythdc2B2RR83 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ythdc2B2RR83 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ythdc2B2RR83 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ythdc2B2RR83 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ythdc2B2RR83 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ythdc2B2RR83 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ythdc2B2RR83 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ythdc2B2RR83 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ythdc2B2RR83 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ythdc2B2RR83 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ythdc2B2RR83 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ythdc2B2RR83 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ythdc2B2RR83 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ythdc2B2RR83 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ythdc2B2RR83 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ythdc2B2RR83 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ythdc2B2RR83 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ythdc2B2RR83 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ythdc2B2RR83 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ythdc2B2RR83 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ythdc2B2RR83 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ythdc2B2RR83 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ythdc2B2RR83 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ythdc2B2RR83 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms