Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf3B2RQG2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms