Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brpf3B2KF05 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brpf3B2KF05 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms