Protein–RNA interactions for Protein: B1AYB6

Mbd5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd5B1AYB6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mbd5B1AYB6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Mbd5B1AYB6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mbd5B1AYB6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mbd5B1AYB6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mbd5B1AYB6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mbd5B1AYB6 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mbd5B1AYB6 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mbd5B1AYB6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Mbd5B1AYB6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mbd5B1AYB6 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mbd5B1AYB6 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mbd5B1AYB6 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Mbd5B1AYB6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mbd5B1AYB6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mbd5B1AYB6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mbd5B1AYB6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mbd5B1AYB6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mbd5B1AYB6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mbd5B1AYB6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mbd5B1AYB6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Mbd5B1AYB6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mbd5B1AYB6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mbd5B1AYB6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mbd5B1AYB6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mbd5B1AYB6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mbd5B1AYB6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mbd5B1AYB6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mbd5B1AYB6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Mbd5B1AYB6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mbd5B1AYB6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mbd5B1AYB6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mbd5B1AYB6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mbd5B1AYB6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mbd5B1AYB6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mbd5B1AYB6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mbd5B1AYB6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mbd5B1AYB6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mbd5B1AYB6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Mbd5B1AYB6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Mbd5B1AYB6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Mbd5B1AYB6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Mbd5B1AYB6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mbd5B1AYB6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mbd5B1AYB6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mbd5B1AYB6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mbd5B1AYB6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mbd5B1AYB6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Mbd5B1AYB6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mbd5B1AYB6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mbd5B1AYB6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mbd5B1AYB6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mbd5B1AYB6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mbd5B1AYB6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mbd5B1AYB6 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mbd5B1AYB6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mbd5B1AYB6 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mbd5B1AYB6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mbd5B1AYB6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mbd5B1AYB6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mbd5B1AYB6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mbd5B1AYB6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mbd5B1AYB6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Mbd5B1AYB6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mbd5B1AYB6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mbd5B1AYB6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mbd5B1AYB6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mbd5B1AYB6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Mbd5B1AYB6 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mbd5B1AYB6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mbd5B1AYB6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms