Protein–RNA interactions for Protein: B1AWN9

Tnfrsf25, Tumor necrosis factor receptor superfamily, member 25, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf25B1AWN9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnfrsf25B1AWN9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnfrsf25B1AWN9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnfrsf25B1AWN9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnfrsf25B1AWN9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnfrsf25B1AWN9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf25B1AWN9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81 ms