Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scml2B1AVB3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scml2B1AVB3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms