Protein–RNA interactions for Protein: B1AQJ2

Usp36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp36B1AQJ2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp36B1AQJ2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp36B1AQJ2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms