Protein–RNA interactions for Protein: B1APN4

Rhox1, Reproductive homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox1B1APN4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhox1B1APN4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhox1B1APN4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhox1B1APN4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhox1B1APN4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhox1B1APN4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhox1B1APN4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhox1B1APN4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhox1B1APN4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhox1B1APN4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhox1B1APN4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhox1B1APN4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhox1B1APN4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhox1B1APN4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhox1B1APN4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhox1B1APN4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhox1B1APN4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhox1B1APN4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhox1B1APN4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox1B1APN4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms