Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
H2-M5A7VMS3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M5A7VMS3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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