Protein–RNA interactions for Protein: A7TZF3

Skint4, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint4A7TZF3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Skint4A7TZF3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms