Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3173A6NAS3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3173A6NAS3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3173A6NAS3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3173A6NAS3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3173A6NAS3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3173A6NAS3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3173A6NAS3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3173A6NAS3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3173A6NAS3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3173A6NAS3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3173A6NAS3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3173A6NAS3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3173A6NAS3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3173A6NAS3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3173A6NAS3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3173A6NAS3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3173A6NAS3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3173A6NAS3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3173A6NAS3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3173A6NAS3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3173A6NAS3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3173A6NAS3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3173A6NAS3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3173A6NAS3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3173A6NAS3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3173A6NAS3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3173A6NAS3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3173A6NAS3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3173A6NAS3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3173A6NAS3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3173A6NAS3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3173A6NAS3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3173A6NAS3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3173A6NAS3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3173A6NAS3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3173A6NAS3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3173A6NAS3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3173A6NAS3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3173A6NAS3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3173A6NAS3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3173A6NAS3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3173A6NAS3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3173A6NAS3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3173A6NAS3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3173A6NAS3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3173A6NAS3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3173A6NAS3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3173A6NAS3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3173A6NAS3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3173A6NAS3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3173A6NAS3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3173A6NAS3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3173A6NAS3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3173A6NAS3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3173A6NAS3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3173A6NAS3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3173A6NAS3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3173A6NAS3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3173A6NAS3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3173A6NAS3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3173A6NAS3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3173A6NAS3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3173A6NAS3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3173A6NAS3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3173A6NAS3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3173A6NAS3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3173A6NAS3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gm3173A6NAS3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Gm3173A6NAS3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3173A6NAS3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3173A6NAS3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3173A6NAS3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3173A6NAS3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3173A6NAS3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3173A6NAS3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3173A6NAS3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3173A6NAS3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3173A6NAS3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3173A6NAS3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3173A6NAS3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3173A6NAS3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3173A6NAS3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3173A6NAS3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3173A6NAS3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3173A6NAS3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3173A6NAS3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3173A6NAS3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3173A6NAS3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3173A6NAS3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3173A6NAS3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3173A6NAS3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3173A6NAS3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3173A6NAS3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3173A6NAS3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3173A6NAS3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3173A6NAS3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3173A6NAS3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3173A6NAS3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3173A6NAS3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms