Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc9bA3KGF9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms