Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CatsperbA2RTF1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CatsperbA2RTF1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms