Protein–RNA interactions for Protein: A2RT60

Htra4, Serine protease HTRA4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra4A2RT60 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htra4A2RT60 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Htra4A2RT60 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms