Protein–RNA interactions for Protein: A2RSL7

4931406B18Rik, RIKEN cDNA 4931406B18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931406B18RikA2RSL7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4931406B18RikA2RSL7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms