Protein–RNA interactions for Protein: A2CGC2

Btbd35f3, BTB domain-containing 35, family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Btbd35f3A2CGC2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Btbd35f3A2CGC2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Btbd35f3A2CGC2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Btbd35f3A2CGC2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Btbd35f3A2CGC2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Btbd35f3A2CGC2 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Btbd35f3A2CGC2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Btbd35f3A2CGC2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Btbd35f3A2CGC2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Btbd35f3A2CGC2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Btbd35f3A2CGC2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Btbd35f3A2CGC2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Btbd35f3A2CGC2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Btbd35f3A2CGC2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Btbd35f3A2CGC2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Btbd35f3A2CGC2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Btbd35f3A2CGC2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Btbd35f3A2CGC2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Btbd35f3A2CGC2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms