Protein–RNA interactions for Protein: A2AKG8

Focad, Focadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FocadA2AKG8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FocadA2AKG8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FocadA2AKG8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FocadA2AKG8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FocadA2AKG8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FocadA2AKG8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FocadA2AKG8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FocadA2AKG8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FocadA2AKG8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FocadA2AKG8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FocadA2AKG8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FocadA2AKG8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FocadA2AKG8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FocadA2AKG8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FocadA2AKG8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FocadA2AKG8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
FocadA2AKG8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FocadA2AKG8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FocadA2AKG8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FocadA2AKG8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FocadA2AKG8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FocadA2AKG8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FocadA2AKG8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FocadA2AKG8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FocadA2AKG8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FocadA2AKG8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FocadA2AKG8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FocadA2AKG8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FocadA2AKG8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FocadA2AKG8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms