Protein–RNA interactions for Protein: A2AIR5

Grin3a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA3A, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3aA2AIR5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin3aA2AIR5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin3aA2AIR5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms