Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ambra1A2AH22 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ambra1A2AH22 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms