Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700023F06RikA2AB62 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700023F06RikA2AB62 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms