Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdc27A2A6Q5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdc27A2A6Q5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdc27A2A6Q5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdc27A2A6Q5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdc27A2A6Q5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdc27A2A6Q5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdc27A2A6Q5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdc27A2A6Q5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdc27A2A6Q5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdc27A2A6Q5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdc27A2A6Q5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdc27A2A6Q5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdc27A2A6Q5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdc27A2A6Q5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdc27A2A6Q5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdc27A2A6Q5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdc27A2A6Q5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdc27A2A6Q5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdc27A2A6Q5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdc27A2A6Q5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdc27A2A6Q5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdc27A2A6Q5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdc27A2A6Q5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdc27A2A6Q5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdc27A2A6Q5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdc27A2A6Q5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdc27A2A6Q5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdc27A2A6Q5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdc27A2A6Q5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdc27A2A6Q5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdc27A2A6Q5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdc27A2A6Q5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdc27A2A6Q5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdc27A2A6Q5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdc27A2A6Q5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdc27A2A6Q5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdc27A2A6Q5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cdc27A2A6Q5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cdc27A2A6Q5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cdc27A2A6Q5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cdc27A2A6Q5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Cdc27A2A6Q5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cdc27A2A6Q5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cdc27A2A6Q5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdc27A2A6Q5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdc27A2A6Q5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdc27A2A6Q5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdc27A2A6Q5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdc27A2A6Q5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdc27A2A6Q5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdc27A2A6Q5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdc27A2A6Q5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdc27A2A6Q5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdc27A2A6Q5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdc27A2A6Q5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdc27A2A6Q5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdc27A2A6Q5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdc27A2A6Q5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdc27A2A6Q5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdc27A2A6Q5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdc27A2A6Q5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdc27A2A6Q5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdc27A2A6Q5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdc27A2A6Q5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdc27A2A6Q5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdc27A2A6Q5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdc27A2A6Q5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdc27A2A6Q5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdc27A2A6Q5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Cdc27A2A6Q5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdc27A2A6Q5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Cdc27A2A6Q5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cdc27A2A6Q5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdc27A2A6Q5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdc27A2A6Q5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdc27A2A6Q5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cdc27A2A6Q5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdc27A2A6Q5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdc27A2A6Q5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdc27A2A6Q5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdc27A2A6Q5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdc27A2A6Q5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdc27A2A6Q5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdc27A2A6Q5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdc27A2A6Q5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdc27A2A6Q5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdc27A2A6Q5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdc27A2A6Q5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdc27A2A6Q5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdc27A2A6Q5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdc27A2A6Q5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdc27A2A6Q5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdc27A2A6Q5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdc27A2A6Q5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdc27A2A6Q5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdc27A2A6Q5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdc27A2A6Q5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdc27A2A6Q5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdc27A2A6Q5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms