Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YTW6

Scn2a, Sodium channel protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn2aA0A0J9YTW6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Scn2aA0A0J9YTW6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Scn2aA0A0J9YTW6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Scn2aA0A0J9YTW6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Scn2aA0A0J9YTW6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Scn2aA0A0J9YTW6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Scn2aA0A0J9YTW6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Scn2aA0A0J9YTW6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Scn2aA0A0J9YTW6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Scn2aA0A0J9YTW6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scn2aA0A0J9YTW6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Scn2aA0A0J9YTW6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Scn2aA0A0J9YTW6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Scn2aA0A0J9YTW6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scn2aA0A0J9YTW6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scn2aA0A0J9YTW6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scn2aA0A0J9YTW6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scn2aA0A0J9YTW6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scn2aA0A0J9YTW6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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