Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P1

Trbv30, T cell receptor beta, variable 30 (Fragment), mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv30A0A0B4J1P1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Trbv30A0A0B4J1P1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Trbv30A0A0B4J1P1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Trbv30A0A0B4J1P1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Trbv30A0A0B4J1P1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Trbv30A0A0B4J1P1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Trbv30A0A0B4J1P1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Trbv30A0A0B4J1P1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trbv30A0A0B4J1P1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Trbv30A0A0B4J1P1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
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Trbv30A0A0B4J1P1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Trbv30A0A0B4J1P1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trbv30A0A0B4J1P1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trbv30A0A0B4J1P1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Trbv30A0A0B4J1P1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trbv30A0A0B4J1P1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trbv30A0A0B4J1P1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trbv30A0A0B4J1P1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trbv30A0A0B4J1P1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trbv30A0A0B4J1P1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trbv30A0A0B4J1P1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trbv30A0A0B4J1P1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trbv30A0A0B4J1P1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trbv30A0A0B4J1P1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trbv30A0A0B4J1P1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trbv30A0A0B4J1P1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trbv30A0A0B4J1P1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Trbv30A0A0B4J1P1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trbv30A0A0B4J1P1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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