Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G7

Trbv1, T cell receptor beta, variable 1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv1A0A0B4J1G7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv1A0A0B4J1G7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms