Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXN4

Ighv1-18, Immunoglobulin heavy variable V1-18 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms