Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Gm23554-201ENSMUST00000157818 110 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Krtap27-1-201ENSMUST00000165580 646 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Gm26219-201ENSMUST00000175216 71 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Gm26097-201ENSMUST00000179642 93 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Mir6907-201ENSMUST00000183764 71 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Gm27753-201ENSMUST00000184742 203 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Gm27520-201ENSMUST00000184872 81 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Gm44009-201ENSMUST00000203539 521 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 AC183096.1-201ENSMUST00000226392 130 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 AC154738.5-201ENSMUST00000227397 310 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Gm10351-201ENSMUST00000087694 125 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Gm37204-201ENSMUST00000192389 3961 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Tcf12-207ENSMUST00000183918 4308 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 1700006A11Rik-201ENSMUST00000029598 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Gm21940-201ENSMUST00000204940 2278 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Vmn2r26-201ENSMUST00000032238 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Vmn1r171-205ENSMUST00000226771 2718 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Gm6162-201ENSMUST00000194870 2930 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Gm38259-201ENSMUST00000194602 3534 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Elavl4-205ENSMUST00000106600 3799 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Brip1-201ENSMUST00000044423 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Dbpht2-202ENSMUST00000221311 5341 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Cfap97-206ENSMUST00000164504 4521 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Klhl15-204ENSMUST00000113915 6241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Btbd35f12-201ENSMUST00000178827 1908 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Ccnb3-201ENSMUST00000056725 4475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Olfr362-202ENSMUST00000213817 4059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Gm22269-201ENSMUST00000104002 130 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Gm15714-201ENSMUST00000117168 250 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Gm15936-201ENSMUST00000118706 460 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Gm26027-201ENSMUST00000122725 268 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 AI847159-204ENSMUST00000148997 753 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Gm25386-201ENSMUST00000157814 288 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Gm22316-201ENSMUST00000158012 216 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Gm44032-201ENSMUST00000204841 166 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Cfap54-207ENSMUST00000168110 9903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Gm8674-201ENSMUST00000179367 3047 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Limd1Q9QXD8 Olfr1317-203ENSMUST00000214801 2578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
Limd1Q9QXD8 Olfr1196-202ENSMUST00000216928 4270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
Limd1Q9QXD8 Olfr1317-204ENSMUST00000216988 2488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
Limd1Q9QXD8 Sult1d1-201ENSMUST00000113314 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
Limd1Q9QXD8 Cp-202ENSMUST00000091309 4029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
Limd1Q9QXD8 Gm30302-202ENSMUST00000220773 3511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
Limd1Q9QXD8 Vmn1r45-208ENSMUST00000228662 3309 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.64
Limd1Q9QXD8 Zfp738-203ENSMUST00000137496 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Limd1Q9QXD8 A630033H20Rik-201ENSMUST00000067249 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Limd1Q9QXD8 Vmn1r30-203ENSMUST00000227466 1798 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Limd1Q9QXD8 Olfr1535-202ENSMUST00000217519 3959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Limd1Q9QXD8 Gm38235-201ENSMUST00000194600 4952 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Limd1Q9QXD8 B930086L07Rik-201ENSMUST00000209529 3738 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Limd1Q9QXD8 Gm4567-202ENSMUST00000190554 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Limd1Q9QXD8 Gm10668-202ENSMUST00000191073 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Limd1Q9QXD8 Gm6902-202ENSMUST00000191169 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Limd1Q9QXD8 Gm6176-202ENSMUST00000207633 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Limd1Q9QXD8 Vmn1r184-204ENSMUST00000227534 4807 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Limd1Q9QXD8 Rnf213-202ENSMUST00000131035 16716 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Limd1Q9QXD8 Znrd1-201ENSMUST00000113669 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Limd1Q9QXD8 Gm12683-201ENSMUST00000117528 415 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Limd1Q9QXD8 Mir1966-201ENSMUST00000158807 108 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Limd1Q9QXD8 Gm29428-201ENSMUST00000190086 409 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Limd1Q9QXD8 Gm7449-201ENSMUST00000194393 663 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Limd1Q9QXD8 Ighv15-1-201ENSMUST00000194450 276 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Limd1Q9QXD8 Gm44389-201ENSMUST00000203795 182 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Limd1Q9QXD8 Gm45539-201ENSMUST00000210313 428 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Limd1Q9QXD8 D730003K21Rik-201ENSMUST00000215052 589 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Limd1Q9QXD8 Gm25134-201ENSMUST00000082646 160 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Limd1Q9QXD8 Zfp300-201ENSMUST00000040667 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Limd1Q9QXD8 Vmn1r22-202ENSMUST00000227650 3674 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Limd1Q9QXD8 Gm7173-201ENSMUST00000101410 2832 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Limd1Q9QXD8 Btbd35f17-201ENSMUST00000105014 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Limd1Q9QXD8 Btbd35f28-201ENSMUST00000105015 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Limd1Q9QXD8 Btbd35f18-201ENSMUST00000105019 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Limd1Q9QXD8 Btbd35f11-201ENSMUST00000105020 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Limd1Q9QXD8 Gm2042-201ENSMUST00000110145 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Limd1Q9QXD8 Gm42548-201ENSMUST00000202669 3933 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Limd1Q9QXD8 Gm2042-207ENSMUST00000181326 2440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Limd1Q9QXD8 Olfr1270-205ENSMUST00000216354 4836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Limd1Q9QXD8 Vps13d-202ENSMUST00000036579 15849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Limd1Q9QXD8 Olfr470-203ENSMUST00000220193 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Limd1Q9QXD8 Traj56-201ENSMUST00000103689 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Limd1Q9QXD8 Gm12934-201ENSMUST00000119221 343 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Limd1Q9QXD8 Gm22204-201ENSMUST00000122654 327 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Limd1Q9QXD8 Gm7582-201ENSMUST00000160831 603 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Limd1Q9QXD8 Cr2-206ENSMUST00000193801 206 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Limd1Q9QXD8 Gm44261-201ENSMUST00000203337 209 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Limd1Q9QXD8 Gm25815-201ENSMUST00000082755 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Limd1Q9QXD8 n-R5s167-201ENSMUST00000083227 121 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Limd1Q9QXD8 Cacnb4-202ENSMUST00000102760 7872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Limd1Q9QXD8 Angpt1-201ENSMUST00000022921 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Limd1Q9QXD8 Abi3bp-202ENSMUST00000096012 4387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Limd1Q9QXD8 AC165106.3-201ENSMUST00000228191 3843 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Limd1Q9QXD8 AC153563.1-202ENSMUST00000217695 1838 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Limd1Q9QXD8 Ogt-201ENSMUST00000044475 5384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Limd1Q9QXD8 Gm42946-201ENSMUST00000196108 2570 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Limd1Q9QXD8 Elf1-202ENSMUST00000110835 3888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Limd1Q9QXD8 Ighv16-1-201ENSMUST00000103470 299 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Limd1Q9QXD8 Gm22816-201ENSMUST00000157450 117 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Limd1Q9QXD8 Gm24745-201ENSMUST00000157840 85 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Limd1Q9QXD8 Gm22314-201ENSMUST00000158007 281 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Limd1Q9QXD8 Gm27445-201ENSMUST00000184484 72 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
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