Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Olfr730-202ENSMUST00000205837 4903 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm25097-201ENSMUST00000104042 145 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm23991-201ENSMUST00000117033 93 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm15037-201ENSMUST00000120358 259 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm14651-201ENSMUST00000147192 442 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm28347-201ENSMUST00000185380 382 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm28706-201ENSMUST00000186830 355 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm6059-201ENSMUST00000196903 340 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm43142-201ENSMUST00000198670 361 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm43228-201ENSMUST00000200735 264 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Olfr184-ps1-201ENSMUST00000205922 516 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm45146-201ENSMUST00000207108 221 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm45791-201ENSMUST00000212908 352 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 AL450317.1-201ENSMUST00000213941 291 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 AC167977.1-201ENSMUST00000221384 234 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm14322-201ENSMUST00000108942 1074 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm14322-202ENSMUST00000119838 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm14418-202ENSMUST00000128657 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm17164-201ENSMUST00000169013 506 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm26365-201ENSMUST00000179177 94 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm27942-201ENSMUST00000184669 101 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm28438-201ENSMUST00000188299 345 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm28779-201ENSMUST00000189678 323 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm31520-201ENSMUST00000203048 733 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm34662-201ENSMUST00000220502 215 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 AC121960.3-201ENSMUST00000227077 623 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 AC165284.1-201ENSMUST00000228614 458 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Olfr57-201ENSMUST00000082244 1080 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 mt-Nd3-201ENSMUST00000082411 348 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm24151-201ENSMUST00000082758 141 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm24928-201ENSMUST00000083399 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm22740-201ENSMUST00000083439 109 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm25897-201ENSMUST00000083709 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Sult3a1-201ENSMUST00000092597 1047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm13212-201ENSMUST00000097794 1221 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Mir208b-201ENSMUST00000104735 77 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm14368-201ENSMUST00000145305 415 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm13782-201ENSMUST00000149515 352 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm24060-201ENSMUST00000157494 95 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm23558-201ENSMUST00000157823 80 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm24754-201ENSMUST00000177997 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Mup-ps7-201ENSMUST00000178292 545 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Mup-ps8-201ENSMUST00000178663 545 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Mup-ps6-201ENSMUST00000179564 545 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm26722-201ENSMUST00000181237 1048 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm44052-201ENSMUST00000203382 396 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm43994-201ENSMUST00000203809 227 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm18268-201ENSMUST00000208445 943 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm44954-201ENSMUST00000208513 227 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Prl2c5-201ENSMUST00000021778 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 AC153529.1-201ENSMUST00000217818 370 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 AC154271.1-201ENSMUST00000224780 383 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 AC115357.1-201ENSMUST00000227575 466 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Olfr394-201ENSMUST00000071478 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Zfp600-201ENSMUST00000092750 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm25497-201ENSMUST00000104425 132 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm14795-201ENSMUST00000118461 471 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm4732-201ENSMUST00000118778 473 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm14517-201ENSMUST00000119040 337 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm14979-201ENSMUST00000121561 1035 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm14951-201ENSMUST00000143622 570 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps62-201ENSMUST00000174119 616 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm25247-201ENSMUST00000175475 90 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm29242-201ENSMUST00000186570 457 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Ighv1-6-201ENSMUST00000193849 293 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm37119-201ENSMUST00000195691 389 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm43096-201ENSMUST00000196173 421 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Igkv15-102-201ENSMUST00000197885 287 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm43407-201ENSMUST00000199816 317 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm44818-201ENSMUST00000206608 358 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Mir103-2-201ENSMUST00000083629 86 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Mir211-201ENSMUST00000083651 106 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm23104-201ENSMUST00000083722 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Olfr711-203ENSMUST00000216335 4724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r73-202ENSMUST00000226516 6155 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm23431-201ENSMUST00000104006 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm22780-201ENSMUST00000104084 132 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Rab11fip4os2-202ENSMUST00000132921 355 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Lce6a-201ENSMUST00000138403 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm25981-201ENSMUST00000157921 295 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm15562-201ENSMUST00000161397 426 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm17061-201ENSMUST00000163167 499 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps62-201ENSMUST00000173275 910 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm26870-202ENSMUST00000181572 1143 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm6639-204ENSMUST00000199182 800 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Olfr189-ps1-201ENSMUST00000205310 804 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm45868-201ENSMUST00000210247 473 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 AC126275.1-201ENSMUST00000224881 446 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 AC101945.3-201ENSMUST00000226568 153 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 AC133176.1-201ENSMUST00000226668 219 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Olfr1193-201ENSMUST00000081697 957 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm23939-201ENSMUST00000082880 133 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm5152-202ENSMUST00000088625 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm10801-201ENSMUST00000099684 504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 C030005K15Rik-201ENSMUST00000166373 1882 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Olfr867-202ENSMUST00000212098 4228 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm11367-201ENSMUST00000117802 120 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm13355-201ENSMUST00000117996 317 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm14989-201ENSMUST00000120497 207 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
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