Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 AC155922.1-201ENSMUST00000220100 373 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Irx5Q9JKQ4 Gm9616-201ENSMUST00000221154 781 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Irx5Q9JKQ4 CT009713.6-201ENSMUST00000223615 294 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Irx5Q9JKQ4 Snord21-201ENSMUST00000082519 94 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Irx5Q9JKQ4 Gm25411-201ENSMUST00000083760 151 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Irx5Q9JKQ4 Clvs1-201ENSMUST00000038841 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Irx5Q9JKQ4 Tdo2-201ENSMUST00000029645 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Irx5Q9JKQ4 AC153969.1-201ENSMUST00000214047 2605 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Irx5Q9JKQ4 Ccdc7a-205ENSMUST00000214889 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Irx5Q9JKQ4 Slc5a3-201ENSMUST00000113975 10913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Irx5Q9JKQ4 Gm38152-201ENSMUST00000195389 3566 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Irx5Q9JKQ4 Gm29112-201ENSMUST00000188962 3487 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Irx5Q9JKQ4 Gm45854-201ENSMUST00000211857 3488 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Irx5Q9JKQ4 A230057D06Rik-203ENSMUST00000208953 3357 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Irx5Q9JKQ4 Postn-204ENSMUST00000117373 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Irx5Q9JKQ4 Olfr1229-202ENSMUST00000213883 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Irx5Q9JKQ4 Klhl28-203ENSMUST00000222508 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Irx5Q9JKQ4 Trps1-202ENSMUST00000165201 9859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Irx5Q9JKQ4 Gm37726-201ENSMUST00000193246 3886 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Irx5Q9JKQ4 Olfr397-202ENSMUST00000213134 4048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Irx5Q9JKQ4 Gm25595-201ENSMUST00000102273 97 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Irx5Q9JKQ4 Gm22266-201ENSMUST00000104011 138 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Irx5Q9JKQ4 Gm25610-201ENSMUST00000104016 129 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Irx5Q9JKQ4 Gm25169-201ENSMUST00000104190 129 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Irx5Q9JKQ4 Gm23772-201ENSMUST00000104433 102 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Irx5Q9JKQ4 Rpl38-ps2-201ENSMUST00000117356 213 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Irx5Q9JKQ4 Gm8129-201ENSMUST00000118230 213 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Irx5Q9JKQ4 Defa-ps11-201ENSMUST00000119719 299 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Irx5Q9JKQ4 Gm11479-201ENSMUST00000134275 387 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Irx5Q9JKQ4 Gm23993-201ENSMUST00000157478 144 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Irx5Q9JKQ4 Gm23641-201ENSMUST00000157857 101 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Irx5Q9JKQ4 Gm24726-201ENSMUST00000158232 121 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Irx5Q9JKQ4 Gm17113-201ENSMUST00000170118 171 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Irx5Q9JKQ4 Gm17067-202ENSMUST00000180131 123 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Irx5Q9JKQ4 Gm28097-201ENSMUST00000187333 366 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Irx5Q9JKQ4 Ighv1-28-201ENSMUST00000192987 351 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Irx5Q9JKQ4 Fam183b-201ENSMUST00000060581 493 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Irx5Q9JKQ4 Gm23445-201ENSMUST00000082800 107 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Irx5Q9JKQ4 Gm24203-201ENSMUST00000082949 114 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Irx5Q9JKQ4 Gm22970-201ENSMUST00000083304 186 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Irx5Q9JKQ4 Mir99a-201ENSMUST00000083596 65 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Irx5Q9JKQ4 Olfr1012-203ENSMUST00000214958 3076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Irx5Q9JKQ4 4932438A13Rik-201ENSMUST00000057272 15883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Irx5Q9JKQ4 Slco1a5-201ENSMUST00000081380 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Irx5Q9JKQ4 AC126673.3-201ENSMUST00000223414 3829 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
Irx5Q9JKQ4 Gcc2-208ENSMUST00000162860 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
Irx5Q9JKQ4 March1-211ENSMUST00000178982 4012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Irx5Q9JKQ4 Gm15350-201ENSMUST00000135138 569 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Irx5Q9JKQ4 Gm24747-201ENSMUST00000157835 87 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Irx5Q9JKQ4 1700058P15Rik-201ENSMUST00000159981 413 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Irx5Q9JKQ4 Gm27189-201ENSMUST00000184119 190 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Irx5Q9JKQ4 Gm28076-201ENSMUST00000188337 410 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Irx5Q9JKQ4 Trbv18-201ENSMUST00000194256 294 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Irx5Q9JKQ4 Gm45839-201ENSMUST00000209884 399 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Irx5Q9JKQ4 AL590503.1-201ENSMUST00000222053 321 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Irx5Q9JKQ4 AC241593.2-201ENSMUST00000225099 510 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Irx5Q9JKQ4 Fxyd3-201ENSMUST00000072331 439 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Irx5Q9JKQ4 n-R5s167-201ENSMUST00000083227 121 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Irx5Q9JKQ4 Gm44433-201ENSMUST00000203540 4832 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Irx5Q9JKQ4 2310001H17Rik-203ENSMUST00000181517 3981 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Irx5Q9JKQ4 Fap-202ENSMUST00000102732 2751 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Irx5Q9JKQ4 B230206I08Rik-201ENSMUST00000207479 3191 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Irx5Q9JKQ4 Olfr1120-202ENSMUST00000215163 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Irx5Q9JKQ4 Xist-201ENSMUST00000127786 17769 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Irx5Q9JKQ4 Vmn2r75-201ENSMUST00000167830 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Irx5Q9JKQ4 Gabrg2-203ENSMUST00000109290 2868 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Irx5Q9JKQ4 Zfp934-202ENSMUST00000101547 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Irx5Q9JKQ4 AC121569.1-201ENSMUST00000221043 3666 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Irx5Q9JKQ4 Txlng-202ENSMUST00000112314 3348 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Irx5Q9JKQ4 Nsd1-201ENSMUST00000099490 12784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Irx5Q9JKQ4 Mir680-3-201ENSMUST00000102298 87 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Irx5Q9JKQ4 Gm24282-201ENSMUST00000104232 66 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Irx5Q9JKQ4 Rab11fip4os2-202ENSMUST00000132921 355 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Irx5Q9JKQ4 Gm13092-201ENSMUST00000136346 260 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Irx5Q9JKQ4 Gm24441-201ENSMUST00000157235 281 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Irx5Q9JKQ4 Pnrc2-203ENSMUST00000180300 171 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Irx5Q9JKQ4 Gm29155-202ENSMUST00000186289 216 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Irx5Q9JKQ4 C4bp-ps1-201ENSMUST00000189393 706 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Irx5Q9JKQ4 Gm46233-201ENSMUST00000217831 449 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Irx5Q9JKQ4 Gm46998-201ENSMUST00000221444 330 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Irx5Q9JKQ4 AL731706.1-202ENSMUST00000226652 180 ntAPPRIS P5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Irx5Q9JKQ4 Mir504-201ENSMUST00000093602 79 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Irx5Q9JKQ4 Olfr1286-203ENSMUST00000213210 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Irx5Q9JKQ4 Olfr291-202ENSMUST00000217039 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Irx5Q9JKQ4 Ankrd12-201ENSMUST00000038116 8991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Irx5Q9JKQ4 Pnpla8-204ENSMUST00000143771 2974 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Irx5Q9JKQ4 Zfp37-207ENSMUST00000222748 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Irx5Q9JKQ4 Mybpc1-201ENSMUST00000119185 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Irx5Q9JKQ4 Gm24951-201ENSMUST00000102182 109 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Irx5Q9JKQ4 Traj42-201ENSMUST00000103700 64 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Irx5Q9JKQ4 Snord89-201ENSMUST00000104516 110 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Irx5Q9JKQ4 Gm12458-201ENSMUST00000119387 495 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Irx5Q9JKQ4 Gm26091-201ENSMUST00000122704 82 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Irx5Q9JKQ4 Gm24998-201ENSMUST00000157908 89 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Irx5Q9JKQ4 Gm24553-201ENSMUST00000158653 131 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Irx5Q9JKQ4 Ighv1-78-201ENSMUST00000163670 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Irx5Q9JKQ4 Gm5967-201ENSMUST00000172723 494 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Irx5Q9JKQ4 Gm25464-201ENSMUST00000175481 107 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Irx5Q9JKQ4 Mir6412-201ENSMUST00000184477 97 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Irx5Q9JKQ4 AC123064.2-201ENSMUST00000217758 193 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.5 ms