Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Gm43402-201ENSMUST00000197159 159 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ddx28Q9CWT6 Gm43393-201ENSMUST00000200147 194 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ddx28Q9CWT6 4930596I21Rik-201ENSMUST00000200494 461 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
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Ddx28Q9CWT6 Ccdc18-201ENSMUST00000047677 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
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Ddx28Q9CWT6 Gm14632-201ENSMUST00000101654 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
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Ddx28Q9CWT6 Gm25461-201ENSMUST00000179293 79 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ddx28Q9CWT6 Gm27588-201ENSMUST00000185096 263 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ddx28Q9CWT6 Gm28217-201ENSMUST00000188613 648 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ddx28Q9CWT6 Gm45556-201ENSMUST00000210689 345 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ddx28Q9CWT6 AC174457.1-201ENSMUST00000215932 226 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ddx28Q9CWT6 Gm20102-201ENSMUST00000222445 220 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ddx28Q9CWT6 AC154747.1-201ENSMUST00000225265 239 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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