Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Gm7909-201ENSMUST00000182688 614 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ddb2Q99J79 Gm29429-201ENSMUST00000187071 121 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ddb2Q99J79 Gm20257-202ENSMUST00000188643 130 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ddb2Q99J79 Gm9379-201ENSMUST00000196790 646 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ddb2Q99J79 Gm43529-201ENSMUST00000199178 412 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ddb2Q99J79 Gm44473-201ENSMUST00000204039 152 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ddb2Q99J79 Gm43955-201ENSMUST00000204332 142 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ddb2Q99J79 Gm44030-201ENSMUST00000204865 432 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ddb2Q99J79 Gm15927-204ENSMUST00000206075 372 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Ddb2Q99J79 AC125223.1-203ENSMUST00000225304 498 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ddb2Q99J79 AC147545.1-201ENSMUST00000227528 108 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ddb2Q99J79 Defb39-201ENSMUST00000075504 252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Ddb2Q99J79 Gm23625-201ENSMUST00000082457 100 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ddb2Q99J79 Gm26457-201ENSMUST00000082678 78 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ddb2Q99J79 Gm25482-201ENSMUST00000083225 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ddb2Q99J79 Mir27a-201ENSMUST00000083510 87 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ddb2Q99J79 Mir21a-201ENSMUST00000083521 92 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ddb2Q99J79 Olfr1253-202ENSMUST00000213484 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Ddb2Q99J79 Gm3095-201ENSMUST00000164696 1568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Ddb2Q99J79 Vmn2r90-201ENSMUST00000169805 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Ddb2Q99J79 Gm43663-201ENSMUST00000198643 1505 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ddb2Q99J79 Vmn1r45-205ENSMUST00000227571 2757 ntBASIC3.28□□□□□ -1.89
Ddb2Q99J79 Gm5724-201ENSMUST00000148411 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.89
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Ddb2Q99J79 Olfr1033-204ENSMUST00000215682 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ddb2Q99J79 0610010F05Rik-201ENSMUST00000043356 4392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ddb2Q99J79 Macf1-206ENSMUST00000106224 23402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ddb2Q99J79 CT025577.1-201ENSMUST00000220862 2846 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ddb2Q99J79 Kctd4-201ENSMUST00000050120 3998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ddb2Q99J79 Strbp-201ENSMUST00000028279 16348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
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Ddb2Q99J79 Neurod4-201ENSMUST00000061571 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
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Ddb2Q99J79 AC125379.1-201ENSMUST00000221928 111 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
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Ddb2Q99J79 4930512M02Rik-201ENSMUST00000081896 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
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Ddb2Q99J79 Gm36989-201ENSMUST00000193225 2160 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ddb2Q99J79 Ifi203-ps-201ENSMUST00000155076 2556 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ddb2Q99J79 Vmn1r89-202ENSMUST00000226717 4120 ntAPPRIS P2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ddb2Q99J79 Fancb-201ENSMUST00000057150 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ddb2Q99J79 9330159F19Rik-201ENSMUST00000092627 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ddb2Q99J79 Zfp945-205ENSMUST00000160457 6497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ddb2Q99J79 Gm25169-201ENSMUST00000104190 129 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ddb2Q99J79 Mir294-201ENSMUST00000104710 84 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ddb2Q99J79 Gm15244-201ENSMUST00000121122 130 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ddb2Q99J79 Olfr719-ps-201ENSMUST00000137795 252 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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