Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Mir687-201ENSMUST00000102166 89 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Gm6274-201ENSMUST00000118173 797 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Gm15190-201ENSMUST00000120855 276 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Defa-ps5-201ENSMUST00000121541 279 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Gm12276-201ENSMUST00000121709 301 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Gm23887-201ENSMUST00000122683 172 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Gm8289-201ENSMUST00000144814 1182 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Gm23957-201ENSMUST00000157209 90 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Gm22036-201ENSMUST00000157279 215 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Gm22561-201ENSMUST00000157331 84 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Gm24720-201ENSMUST00000157518 166 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Gm7909-201ENSMUST00000182688 614 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Gm28257-201ENSMUST00000185244 463 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Hmgb1-rs16-201ENSMUST00000185927 613 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Gm36964-201ENSMUST00000191876 198 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Gm38356-201ENSMUST00000194313 408 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Gm43914-201ENSMUST00000203592 594 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Gm43932-201ENSMUST00000204499 52 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 1700030L22Rik-201ENSMUST00000221214 567 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Gm18921-201ENSMUST00000221798 366 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 mt-Co3-201ENSMUST00000082409 784 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Gm22979-201ENSMUST00000082609 159 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Tex16-201ENSMUST00000038546 3972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Gm3239-201ENSMUST00000163525 1751 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Gm8978-201ENSMUST00000124230 2224 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Tfpi-204ENSMUST00000111714 3614 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Vmn1r14-202ENSMUST00000227209 6857 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Vmn2r-ps83-201ENSMUST00000173787 2368 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Olfr747-204ENSMUST00000213238 1416 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Olfr133-204ENSMUST00000215549 2944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Vmn2r75-201ENSMUST00000167830 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Olfr912-201ENSMUST00000217160 5726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Olfr548-ps1-202ENSMUST00000210064 4287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 C130023A14Rik-201ENSMUST00000193537 3087 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Gm22496-201ENSMUST00000104493 88 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Gm23609-201ENSMUST00000104542 127 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Gm12902-201ENSMUST00000118389 322 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Gm12876-201ENSMUST00000120975 408 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Gm11384-201ENSMUST00000121376 303 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Uqcrh-ps2-201ENSMUST00000121613 269 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Gm14768-201ENSMUST00000122126 678 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Gm12649-201ENSMUST00000137509 581 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Gm21814-201ENSMUST00000144085 291 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Gm26426-201ENSMUST00000177866 123 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Gm25175-201ENSMUST00000178712 79 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Gm26060-201ENSMUST00000180094 123 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Gm27410-201ENSMUST00000183851 115 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Gm27648-201ENSMUST00000184315 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Mir8106-201ENSMUST00000184520 139 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 1700015G11Rik-203ENSMUST00000185841 305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Gm7837-201ENSMUST00000190873 412 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Gm37085-201ENSMUST00000193780 196 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Ighv1-32-201ENSMUST00000195149 351 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Nras-ps2-201ENSMUST00000195269 178 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Gm37029-201ENSMUST00000195773 239 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Traj57-202ENSMUST00000196977 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Obox4-ps25-201ENSMUST00000199090 210 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Gm44995-201ENSMUST00000207056 504 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Gm45826-201ENSMUST00000212226 265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Gm26447-201ENSMUST00000082448 129 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Mir21a-201ENSMUST00000083521 92 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Gm10553-201ENSMUST00000097669 372 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Vmn2r101-201ENSMUST00000171914 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 5730507A11Rik-201ENSMUST00000204297 3371 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Cyp3a41b-201ENSMUST00000075837 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Olfr65-201ENSMUST00000106864 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Apobec3Q99J72 Olfr729-203ENSMUST00000215327 4220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Apobec3Q99J72 Olfr729-204ENSMUST00000215451 4236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Apobec3Q99J72 Olfr186-202ENSMUST00000206463 2208 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Apobec3Q99J72 Olfr160-201ENSMUST00000104875 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Apobec3Q99J72 Gm14296-202ENSMUST00000108931 750 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Apobec3Q99J72 Igkv13-85-201ENSMUST00000114212 347 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Apobec3Q99J72 n-R5s179-201ENSMUST00000122564 118 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Apobec3Q99J72 Gm26477-201ENSMUST00000122617 323 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Apobec3Q99J72 Gm22098-201ENSMUST00000157930 85 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Apobec3Q99J72 2210418O10Rik-204ENSMUST00000166464 750 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Apobec3Q99J72 Gm8114-201ENSMUST00000172225 484 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Apobec3Q99J72 Gm26400-201ENSMUST00000175012 85 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Apobec3Q99J72 Gm21776-201ENSMUST00000177676 1083 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Apobec3Q99J72 Gm26501-201ENSMUST00000178307 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Apobec3Q99J72 Gm21913-201ENSMUST00000179880 1083 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Apobec3Q99J72 Gm29512-201ENSMUST00000185544 315 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Apobec3Q99J72 Gm28110-201ENSMUST00000185782 315 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Apobec3Q99J72 Gm28838-201ENSMUST00000186338 315 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Apobec3Q99J72 Gm29057-201ENSMUST00000186468 315 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Apobec3Q99J72 Gm29661-201ENSMUST00000186781 315 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Apobec3Q99J72 Gm28737-201ENSMUST00000186808 315 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Apobec3Q99J72 Gm29118-201ENSMUST00000186908 315 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Apobec3Q99J72 Gm28433-201ENSMUST00000187085 315 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Apobec3Q99J72 Gm29635-201ENSMUST00000187221 315 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Apobec3Q99J72 Gm28759-201ENSMUST00000187621 315 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Apobec3Q99J72 Gm28831-201ENSMUST00000187739 315 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Apobec3Q99J72 Gm28200-201ENSMUST00000187778 315 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Apobec3Q99J72 Gm29026-201ENSMUST00000187787 315 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Apobec3Q99J72 Gm28752-201ENSMUST00000188340 315 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Apobec3Q99J72 Gm28797-201ENSMUST00000188543 315 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Apobec3Q99J72 Gm28855-201ENSMUST00000188680 315 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Apobec3Q99J72 Gm29378-201ENSMUST00000188723 315 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Apobec3Q99J72 Gm28569-201ENSMUST00000188748 315 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Apobec3Q99J72 Gm28120-201ENSMUST00000188812 315 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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