Protein–RNA interactions for Protein: Q921I6

Sh3bp4, SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4Q921I6 Gm37494-202ENSMUST00000188038 16021 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Sh3bp4Q921I6 Olfr1030-201ENSMUST00000056849 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 C87414-206ENSMUST00000162964 2852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Gm43256-201ENSMUST00000199995 3091 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 AC160115.1-201ENSMUST00000224678 1574 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Mir687-201ENSMUST00000102166 89 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Gm23530-201ENSMUST00000104564 137 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Gm23183-201ENSMUST00000122595 323 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Gm15700-201ENSMUST00000139791 821 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Gm22098-201ENSMUST00000157930 85 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Gm25438-201ENSMUST00000158281 110 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Gm24552-201ENSMUST00000158646 103 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Gm24618-201ENSMUST00000177718 94 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Gm23953-201ENSMUST00000178214 94 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Gm26332-201ENSMUST00000179813 94 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Gm22863-201ENSMUST00000180265 94 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Gm27999-201ENSMUST00000183539 193 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Hmgb1-rs16-201ENSMUST00000185927 613 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Gm28932-201ENSMUST00000186300 357 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Ighv1-32-201ENSMUST00000195149 351 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Mir7227-201ENSMUST00000200408 59 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Olfr515-ps1-201ENSMUST00000208389 189 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Gm2829-201ENSMUST00000213121 499 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 AC101984.1-201ENSMUST00000219639 402 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 AC124772.1-201ENSMUST00000221325 151 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 AC147545.1-201ENSMUST00000227528 108 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 mt-Co3-201ENSMUST00000082409 784 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Gm25411-201ENSMUST00000083760 151 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Vmn1r56-201ENSMUST00000169556 1832 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Vmn2r-ps83-201ENSMUST00000173787 2368 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 2610300M13Rik-202ENSMUST00000203716 1787 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Macf1-203ENSMUST00000097897 23495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Gm43268-201ENSMUST00000201536 4055 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Zfp493-201ENSMUST00000164936 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Zfp62-212ENSMUST00000180016 3964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Gabra2-203ENSMUST00000197284 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Gm42888-201ENSMUST00000202425 4361 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Gm21034-201ENSMUST00000207390 2608 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Gm43404-201ENSMUST00000200424 2534 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Gm43881-201ENSMUST00000203051 2530 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Olfr1043-203ENSMUST00000213949 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Gm9157-201ENSMUST00000117673 225 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Gm6071-201ENSMUST00000119561 440 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Tpt1-ps1-201ENSMUST00000120257 436 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Dnal1-203ENSMUST00000136159 403 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Gm23542-201ENSMUST00000158208 96 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Gm7568-203ENSMUST00000161626 415 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Mir5127-201ENSMUST00000175295 71 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Pcgf1-204ENSMUST00000176089 492 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Gm4761-201ENSMUST00000178086 582 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Gm26501-201ENSMUST00000178307 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 1700015G11Rik-203ENSMUST00000185841 305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Gm17916-203ENSMUST00000189918 324 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Gm7837-201ENSMUST00000190873 412 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Gm34732-201ENSMUST00000195441 445 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Igkv2-113-201ENSMUST00000196138 362 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Gm9318-201ENSMUST00000222444 438 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Gm2710-201ENSMUST00000073196 603 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 BC100530-201ENSMUST00000096089 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Olfr1093-202ENSMUST00000213354 2240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Gm4567-202ENSMUST00000190554 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Gm10668-202ENSMUST00000191073 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Gm15127-203ENSMUST00000112753 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Gm43715-201ENSMUST00000196307 2715 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Rictor-201ENSMUST00000061656 9312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Gm8300-201ENSMUST00000110152 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Trbv13-1-201ENSMUST00000103268 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Gm14810-201ENSMUST00000121628 486 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Gm12238-201ENSMUST00000127764 124 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Gm23326-201ENSMUST00000157419 105 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Gm25519-201ENSMUST00000158392 127 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Gm17117-201ENSMUST00000163665 299 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Krtap27-1-201ENSMUST00000165580 646 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Gm26400-201ENSMUST00000175012 85 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Gm21776-201ENSMUST00000177676 1083 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Gm21913-201ENSMUST00000179880 1083 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Gm27410-201ENSMUST00000183851 115 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Gm9696-202ENSMUST00000191541 830 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Ighv1-17-1-201ENSMUST00000194849 351 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Gm43739-201ENSMUST00000198294 307 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Obox4-ps25-201ENSMUST00000199090 210 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Gm32381-201ENSMUST00000203192 476 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Gm44446-201ENSMUST00000204864 255 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 AC129202.3-201ENSMUST00000224413 733 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Sprr2i-201ENSMUST00000047264 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Zfp711-201ENSMUST00000071814 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Gm10161-201ENSMUST00000091506 204 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Acsm3-201ENSMUST00000063770 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Gm44842-201ENSMUST00000209173 3372 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Olfr194-202ENSMUST00000213228 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Olfr298-202ENSMUST00000213223 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Olfr729-203ENSMUST00000215327 4220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Olfr729-204ENSMUST00000215451 4236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Mir673-201ENSMUST00000102361 91 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Gm24403-201ENSMUST00000104616 130 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Igkv13-85-201ENSMUST00000114212 347 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Gm11363-201ENSMUST00000121672 548 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Gm24596-201ENSMUST00000122504 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Gm24936-201ENSMUST00000122598 247 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Sh3bp4Q921I6 Gm15718-201ENSMUST00000131085 311 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms