Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Gm22752-201ENSMUST00000102083 109 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm15266-201ENSMUST00000119635 255 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm15671-201ENSMUST00000124160 576 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm15241-201ENSMUST00000125700 474 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm24393-201ENSMUST00000158135 97 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm25863-201ENSMUST00000158249 329 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm2343-201ENSMUST00000161177 1042 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm23813-201ENSMUST00000175153 77 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm21758-201ENSMUST00000179336 819 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm24306-201ENSMUST00000180229 79 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 1700022E09Rik-202ENSMUST00000188342 387 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm29647-201ENSMUST00000188795 666 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm20832-201ENSMUST00000189076 665 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm29185-201ENSMUST00000190578 516 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm28241-201ENSMUST00000190916 235 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm29192-201ENSMUST00000190942 377 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm28504-201ENSMUST00000190977 666 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Trbv22-201ENSMUST00000191697 291 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm31511-201ENSMUST00000193134 657 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm35843-201ENSMUST00000193716 666 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm30638-201ENSMUST00000195570 656 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm36728-201ENSMUST00000195782 665 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm6059-201ENSMUST00000196903 340 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm42475-201ENSMUST00000201212 295 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm44609-201ENSMUST00000207157 460 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm39154-201ENSMUST00000210257 560 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 AC141895.1-201ENSMUST00000218141 273 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 AC124524.1-201ENSMUST00000225833 181 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 S100a11-201ENSMUST00000029515 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Ogn-201ENSMUST00000021822 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm42524-201ENSMUST00000202881 2214 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Hif1a-202ENSMUST00000110461 4385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Ifi203-202ENSMUST00000081216 3610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Olfr630-201ENSMUST00000106880 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 AC115891.1-201ENSMUST00000215798 1755 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Trbv21-201ENSMUST00000103278 290 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm22771-201ENSMUST00000104449 91 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm14401-203ENSMUST00000108970 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Clec1b-202ENSMUST00000112079 455 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm14657-201ENSMUST00000117461 302 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm15936-201ENSMUST00000118706 460 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Cyp4b1-ps1-201ENSMUST00000118753 315 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm24937-201ENSMUST00000122597 134 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm14271-201ENSMUST00000137886 630 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm25637-201ENSMUST00000157529 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm24959-201ENSMUST00000157924 146 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm17162-201ENSMUST00000168538 473 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Vmn2r-ps70-201ENSMUST00000174636 302 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Trav6-3-202ENSMUST00000183604 305 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Trav6d-3-202ENSMUST00000184883 308 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm18185-201ENSMUST00000186725 667 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm5116-201ENSMUST00000187732 463 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm29627-201ENSMUST00000187984 463 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm28076-201ENSMUST00000188337 410 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm28448-201ENSMUST00000188547 428 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 1700044K03Rik-201ENSMUST00000190201 377 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm38146-201ENSMUST00000194121 1293 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Mir7217-201ENSMUST00000200304 62 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 AL935138.1-201ENSMUST00000215309 196 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 AC112274.2-201ENSMUST00000218436 170 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Olfr731-201ENSMUST00000059565 981 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm22508-201ENSMUST00000082772 110 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 1110057P08Rik-201ENSMUST00000089097 465 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm10717-202ENSMUST00000099042 669 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 AC125374.3-201ENSMUST00000214983 2810 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Olfr851-202ENSMUST00000214130 7123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Adam29-201ENSMUST00000053441 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Knl1-202ENSMUST00000028802 7800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Olfr1487-203ENSMUST00000209005 2061 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm14868-201ENSMUST00000117840 216 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm16155-201ENSMUST00000155180 338 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm22597-201ENSMUST00000157602 80 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm26195-201ENSMUST00000175035 101 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm24757-201ENSMUST00000176987 371 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm24315-201ENSMUST00000177835 127 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm26779-201ENSMUST00000181101 551 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm27582-201ENSMUST00000184084 126 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Mir496b-201ENSMUST00000184935 113 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm6060-201ENSMUST00000188671 251 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm38127-201ENSMUST00000191978 468 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm37757-201ENSMUST00000193072 210 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm16351-202ENSMUST00000209660 337 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Rpl26-ps1-201ENSMUST00000213139 426 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 4930567K20Rik-204ENSMUST00000220270 445 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 CT030187.1-201ENSMUST00000220605 252 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 AC124569.4-201ENSMUST00000223830 1220 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 AC157654.1-201ENSMUST00000224130 820 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 AC154506.1-201ENSMUST00000225178 621 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 AC123656.2-201ENSMUST00000226726 227 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 AC122341.1-201ENSMUST00000227291 560 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 CT030662.1-201ENSMUST00000227380 232 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Olfr340-201ENSMUST00000072854 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Clec4a4-201ENSMUST00000079379 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm23848-201ENSMUST00000083826 106 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm5670-201ENSMUST00000093546 372 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm17969-201ENSMUST00000185706 2557 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Ifi214-203ENSMUST00000139092 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Olfr58-202ENSMUST00000215112 2454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm26015-201ENSMUST00000104402 125 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm8217-201ENSMUST00000119136 465 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.3 ms