Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm28572-201ENSMUST00000187444 318 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Topbp1-ps2-201ENSMUST00000191289 189 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm37455-201ENSMUST00000191993 529 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm44555-201ENSMUST00000209008 148 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm45427-201ENSMUST00000209572 1253 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Olfr662-ps1-201ENSMUST00000210704 396 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm20102-201ENSMUST00000222445 220 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 AL590614.1-201ENSMUST00000226037 268 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 AC166369.3-201ENSMUST00000227286 409 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Ssxa1-201ENSMUST00000072593 433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm26056-201ENSMUST00000083043 104 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Olfr1156-201ENSMUST00000099842 1076 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 AC104897.1-201ENSMUST00000222638 3628 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 9230113P08Rik-201ENSMUST00000176049 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Zc3h14-201ENSMUST00000021399 1430 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm14429-201ENSMUST00000121881 2024 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Olfr166-202ENSMUST00000213531 4205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Olfr968-202ENSMUST00000216458 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Adam29-201ENSMUST00000053441 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm22023-201ENSMUST00000104354 130 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Dppa1-202ENSMUST00000109227 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm14602-201ENSMUST00000118625 340 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm13475-201ENSMUST00000119290 234 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm14574-201ENSMUST00000120644 279 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm25637-201ENSMUST00000157529 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm15629-201ENSMUST00000161819 476 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Obox1-203ENSMUST00000172881 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm25470-201ENSMUST00000175576 111 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Trav7d-4-201ENSMUST00000178768 451 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Trav7-4-201ENSMUST00000181728 451 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm37037-201ENSMUST00000194475 424 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Trbv24-201ENSMUST00000194614 347 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm43083-201ENSMUST00000199594 476 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm43899-201ENSMUST00000203675 246 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 AC154296.2-201ENSMUST00000214696 545 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 AC159203.2-201ENSMUST00000221326 193 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 AC154576.2-202ENSMUST00000223916 688 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Defb9-201ENSMUST00000057076 310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm23627-201ENSMUST00000082459 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm22502-201ENSMUST00000082488 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 n-R5s94-201ENSMUST00000082573 119 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm22977-201ENSMUST00000082615 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm24149-201ENSMUST00000082757 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Olfr1402-202ENSMUST00000199297 4051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Fbxw21-201ENSMUST00000054925 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 2810403D21Rik-202ENSMUST00000124329 1660 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Chst9-201ENSMUST00000053017 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Olfr1104-202ENSMUST00000214857 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 AC122850.1-201ENSMUST00000220380 5690 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Olfr1471-204ENSMUST00000217249 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm22270-201ENSMUST00000104034 132 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm14971-201ENSMUST00000117980 663 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm15807-201ENSMUST00000119880 1128 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm22722-201ENSMUST00000157467 132 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm23588-201ENSMUST00000157659 99 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm22833-201ENSMUST00000158292 132 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 B230216N24Rik-202ENSMUST00000159353 345 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm23523-201ENSMUST00000180190 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm29296-201ENSMUST00000188146 320 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm28506-201ENSMUST00000189937 150 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm43217-201ENSMUST00000199513 367 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm45459-201ENSMUST00000209882 442 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm45252-201ENSMUST00000211579 397 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm7948-201ENSMUST00000212607 844 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 AC105958.2-201ENSMUST00000214167 191 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 AC192333.1-201ENSMUST00000224573 376 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm24045-201ENSMUST00000083113 98 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Olfr1126-202ENSMUST00000213366 1827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Esp34-202ENSMUST00000178654 1413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Olfr592-203ENSMUST00000218618 5978 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Olfr1177-ps-202ENSMUST00000216713 2821 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm381-201ENSMUST00000117443 2037 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm3055-202ENSMUST00000218939 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Zfp781-202ENSMUST00000219144 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Vmn1r80-205ENSMUST00000227755 10455 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm22831-201ENSMUST00000102473 109 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm24280-201ENSMUST00000104237 134 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm26423-201ENSMUST00000104277 128 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm26147-201ENSMUST00000104479 114 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm13761-201ENSMUST00000117238 807 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm12386-201ENSMUST00000117380 688 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm15106-201ENSMUST00000119691 821 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm25270-201ENSMUST00000122606 138 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm12238-201ENSMUST00000127764 124 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm15205-201ENSMUST00000129329 632 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm26101-201ENSMUST00000157246 105 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm25335-201ENSMUST00000158043 103 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm24546-201ENSMUST00000158652 102 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm7582-201ENSMUST00000160831 603 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Ighv12-1-201ENSMUST00000195542 329 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm43600-201ENSMUST00000202134 223 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm36406-202ENSMUST00000203761 551 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm45101-201ENSMUST00000208327 232 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm45772-201ENSMUST00000212961 240 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 AC117656.1-201ENSMUST00000225826 339 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 AC126440.1-201ENSMUST00000227098 349 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 1700084M14Rik-201ENSMUST00000078832 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Gm23650-201ENSMUST00000083355 70 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Mir128-1-201ENSMUST00000083586 70 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Sh3bp1P55194 Olfr1211-203ENSMUST00000213412 4173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
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