Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm25175-201ENSMUST00000178712 79 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm27698-201ENSMUST00000184060 249 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm18775-201ENSMUST00000190763 586 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm18296-201ENSMUST00000192475 783 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm37869-201ENSMUST00000193385 595 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm37279-201ENSMUST00000194630 338 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm44476-201ENSMUST00000196225 91 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 AC155927.1-201ENSMUST00000220114 1200 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Rpl30-ps8-201ENSMUST00000076166 345 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm22229-201ENSMUST00000082987 108 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Rpl31-ps1-201ENSMUST00000085128 378 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm10343-201ENSMUST00000096279 348 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Vmn2r65-201ENSMUST00000044583 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 AC158598.1-201ENSMUST00000214349 3847 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Trbv5-201ENSMUST00000103266 368 ntAPPRIS P1 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm23803-201ENSMUST00000104610 132 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Catsper4-202ENSMUST00000105878 632 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm12878-201ENSMUST00000118744 332 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm13804-201ENSMUST00000119552 172 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm12876-201ENSMUST00000120975 408 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm12096-201ENSMUST00000121149 829 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm12272-201ENSMUST00000138136 333 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm25224-201ENSMUST00000158195 68 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm20538-201ENSMUST00000166808 225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm15564-202ENSMUST00000173605 402 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm22166-201ENSMUST00000178419 121 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm23288-201ENSMUST00000179213 121 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Mir6402-201ENSMUST00000183406 80 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Mir6335-201ENSMUST00000184081 98 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Mir7j-201ENSMUST00000184427 122 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm8392-201ENSMUST00000185647 835 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Igkv11-118-201ENSMUST00000199448 346 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm42604-201ENSMUST00000200077 801 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm44083-201ENSMUST00000203114 337 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm44923-201ENSMUST00000206673 85 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Olfr861-ps1-201ENSMUST00000212783 928 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Olfr941-ps1-201ENSMUST00000215258 935 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 CT572985.2-201ENSMUST00000220496 211 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 AC173482.2-201ENSMUST00000224044 750 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm10717-201ENSMUST00000075573 684 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm26446-201ENSMUST00000082455 103 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm25586-201ENSMUST00000082499 112 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm15292-201ENSMUST00000098895 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Olfr835-202ENSMUST00000213018 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm44049-201ENSMUST00000204905 2984 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Zfp984-201ENSMUST00000105734 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm25526-201ENSMUST00000104332 132 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Mir878-201ENSMUST00000104680 78 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm11042-201ENSMUST00000110441 120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm22488-201ENSMUST00000116811 127 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm25507-201ENSMUST00000116981 144 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm11891-201ENSMUST00000121241 619 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm14736-201ENSMUST00000121470 336 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm12770-201ENSMUST00000121734 462 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm25270-201ENSMUST00000122606 138 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Pfdn4-205ENSMUST00000136839 452 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm23588-201ENSMUST00000157659 99 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm22093-201ENSMUST00000158980 111 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Olfr733-201ENSMUST00000163469 994 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm17224-201ENSMUST00000171429 500 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
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Ccl20O89093 Gm25748-201ENSMUST00000175487 70 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm23379-201ENSMUST00000180026 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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Ccl20O89093 Gm43284-201ENSMUST00000200103 253 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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Ccl20O89093 Gm44693-201ENSMUST00000208141 460 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm44600-201ENSMUST00000208540 111 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm45366-201ENSMUST00000209828 384 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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Ccl20O89093 AC112274.2-201ENSMUST00000218436 170 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 4930567K20Rik-204ENSMUST00000220270 445 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 AC155634.2-201ENSMUST00000222001 489 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 CT025689.4-201ENSMUST00000225926 601 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 AC108945.1-201ENSMUST00000226477 94 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Zfp706-205ENSMUST00000228275 481 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Olfr937-201ENSMUST00000055567 936 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Snord104-201ENSMUST00000083192 70 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Olfr1086-201ENSMUST00000099878 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Olfr1025-ps1-202ENSMUST00000213474 3578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm38162-201ENSMUST00000195562 4597 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Ccdc178-201ENSMUST00000025160 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
Ccl20O89093 Gm14325-203ENSMUST00000188914 1494 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm11228-201ENSMUST00000143796 2013 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm11410-201ENSMUST00000120053 1143 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm14301-201ENSMUST00000120181 324 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm12155-201ENSMUST00000121267 160 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm14766-201ENSMUST00000121689 367 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm16411-201ENSMUST00000122164 1100 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm15077-201ENSMUST00000122344 362 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm28305-201ENSMUST00000147249 365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm24691-201ENSMUST00000157762 140 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm24393-201ENSMUST00000158135 97 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm8580-201ENSMUST00000160295 464 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm9071-201ENSMUST00000165915 474 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm6788-201ENSMUST00000166459 270 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm5224-201ENSMUST00000183060 350 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm29604-201ENSMUST00000187176 163 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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