Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Gm2436-201ENSMUST00000219562 774 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 AC122393.3-201ENSMUST00000226343 1059 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 AC115291.1-201ENSMUST00000226803 258 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 AC160550.3-201ENSMUST00000226818 400 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Snord7-201ENSMUST00000083781 97 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm25512-201ENSMUST00000083863 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Vmn1r185-202ENSMUST00000226694 5656 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Olfr1039-202ENSMUST00000214364 3925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm42524-201ENSMUST00000202881 2214 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Olfr811-202ENSMUST00000215058 2508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Olfr299-202ENSMUST00000217253 4479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 AC122850.1-201ENSMUST00000220380 5690 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm15084-201ENSMUST00000178585 1502 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Mir693-201ENSMUST00000102187 89 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm24275-201ENSMUST00000116780 146 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm12255-201ENSMUST00000117184 284 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm14837-201ENSMUST00000119688 206 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm13717-201ENSMUST00000119868 365 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm14678-201ENSMUST00000121396 482 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm15381-201ENSMUST00000121501 1156 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm25807-201ENSMUST00000122783 305 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm3669-202ENSMUST00000127852 397 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm2101-201ENSMUST00000128191 397 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm2165-205ENSMUST00000155337 397 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm23411-201ENSMUST00000157988 62 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm22434-201ENSMUST00000158549 122 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Vmn2r-ps33-201ENSMUST00000175691 904 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm24757-201ENSMUST00000176987 371 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm28399-201ENSMUST00000186221 318 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm28572-201ENSMUST00000187444 318 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Olfr468-ps1-201ENSMUST00000207203 593 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Nbdy-205ENSMUST00000208235 132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm45459-201ENSMUST00000209882 442 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 AC102312.1-201ENSMUST00000217752 475 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 AC069074.2-201ENSMUST00000217819 428 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 AC159203.2-201ENSMUST00000221326 193 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 LOC667541-201ENSMUST00000223408 278 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 AC129202.2-201ENSMUST00000225123 177 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm10088-201ENSMUST00000074116 423 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 n-R5s40-201ENSMUST00000082475 124 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm23404-201ENSMUST00000082543 97 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm24045-201ENSMUST00000083113 98 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm23741-201ENSMUST00000097237 171 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm43016-201ENSMUST00000196628 3150 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Olfr124-203ENSMUST00000216478 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Olfr1354-203ENSMUST00000217073 3792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Nexn-211ENSMUST00000199423 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm12128-201ENSMUST00000131013 2914 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm43879-201ENSMUST00000203811 3760 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Tlr7-203ENSMUST00000112164 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Olfr722-201ENSMUST00000053290 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm8880-201ENSMUST00000121800 454 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm22957-201ENSMUST00000122511 123 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm25827-201ENSMUST00000157089 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm23325-201ENSMUST00000157422 129 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm17162-201ENSMUST00000168538 473 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm20450-201ENSMUST00000173652 147 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Mir5136-201ENSMUST00000175573 76 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm10105-201ENSMUST00000184601 270 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Ranbp2-ps10-201ENSMUST00000185097 385 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Ighv1-46-201ENSMUST00000193988 351 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Ighv12-1-201ENSMUST00000195542 329 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm43723-201ENSMUST00000196886 189 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm36406-202ENSMUST00000203761 551 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Olfr1556-ps1-201ENSMUST00000204688 466 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm36368-201ENSMUST00000212026 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 AL450317.1-201ENSMUST00000213941 291 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 AC147240.1-201ENSMUST00000218767 431 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm46367-202ENSMUST00000222771 501 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 AC122418.1-201ENSMUST00000225012 511 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 mt-Td-201ENSMUST00000082404 70 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm25579-201ENSMUST00000083407 106 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm23096-201ENSMUST00000083447 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Mir21a-201ENSMUST00000083521 92 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Klra3-201ENSMUST00000088017 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm36944-201ENSMUST00000192257 2759 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Olfr609-202ENSMUST00000216075 3429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Esp34-201ENSMUST00000173055 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Olfr352-202ENSMUST00000217325 3337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Ccdc178-201ENSMUST00000025160 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm37236-201ENSMUST00000193670 3249 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm44230-201ENSMUST00000203032 3550 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Olfr1369-ps1-205ENSMUST00000215941 3597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Olfr1245-202ENSMUST00000217402 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm5483-201ENSMUST00000114858 414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm9009-201ENSMUST00000117321 326 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm14355-201ENSMUST00000117352 264 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm12872-201ENSMUST00000121835 320 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm25107-201ENSMUST00000122472 129 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm14333-201ENSMUST00000130484 264 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm24857-201ENSMUST00000158061 310 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm24737-201ENSMUST00000158861 100 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm15900-201ENSMUST00000161584 342 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm26195-201ENSMUST00000175035 101 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm10717-205ENSMUST00000177601 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm21171-201ENSMUST00000180048 673 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm28930-201ENSMUST00000189525 437 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 6430573P05Rik-201ENSMUST00000192562 508 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 A930014E01Rik-201ENSMUST00000194572 330 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm43624-201ENSMUST00000197368 180 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
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