Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm37993-201ENSMUST00000195301 988 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm17935-201ENSMUST00000196649 772 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm43541-201ENSMUST00000197208 581 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Olfr428-ps1-201ENSMUST00000201135 466 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm44615-201ENSMUST00000206548 358 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Cyp3a61-ps1-201ENSMUST00000218470 592 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 AC154426.1-201ENSMUST00000225614 1132 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 AC155314.1-201ENSMUST00000227624 508 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Olfr1489-201ENSMUST00000053113 1111 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Pip-201ENSMUST00000075351 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm23628-201ENSMUST00000082464 173 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm10800-201ENSMUST00000099683 660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 A630010A05Rik-201ENSMUST00000100165 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Ighv3-1-201ENSMUST00000103478 350 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm8161-201ENSMUST00000168739 481 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Mir6383-201ENSMUST00000184545 116 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm27715-201ENSMUST00000184714 260 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Trbv12-3-201ENSMUST00000192675 372 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm43731-201ENSMUST00000196150 666 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm44727-201ENSMUST00000204225 451 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm31294-201ENSMUST00000211216 138 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 AC125488.1-201ENSMUST00000219586 212 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Gm30738-201ENSMUST00000221346 502 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 AC124524.1-201ENSMUST00000225833 181 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Olfr812-203ENSMUST00000205013 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Col5a3Q9JLI2 Mir1192-201ENSMUST00000116976 121 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm12238-201ENSMUST00000127764 124 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm26349-201ENSMUST00000157530 130 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm16289-201ENSMUST00000162079 183 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm17062-201ENSMUST00000166987 461 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm20534-201ENSMUST00000172957 172 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps26-201ENSMUST00000174239 840 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Mir7063-201ENSMUST00000184158 91 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm44392-201ENSMUST00000196758 115 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm44693-201ENSMUST00000208141 460 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 CT573422.1-201ENSMUST00000216655 405 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm3442-201ENSMUST00000216808 710 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 AC159380.1-201ENSMUST00000218096 121 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Olfr1324-203ENSMUST00000219631 1152 ntAPPRIS P2 BASIC1.59□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 4930567K20Rik-204ENSMUST00000220270 445 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 AC126043.1-201ENSMUST00000221304 1141 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 AC154424.1-201ENSMUST00000225883 799 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 AC113031.2-201ENSMUST00000226132 579 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Olfr1324-201ENSMUST00000050044 1152 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.59□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm21994-201ENSMUST00000063463 990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Olfr952-201ENSMUST00000073895 1056 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm26437-201ENSMUST00000082595 105 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Olfr1156-201ENSMUST00000099842 1076 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Hsf3-205ENSMUST00000179832 1972 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm25313-201ENSMUST00000101817 116 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm24340-201ENSMUST00000104208 97 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm12351-201ENSMUST00000118727 292 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm12327-201ENSMUST00000121729 1168 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm14903-201ENSMUST00000122435 537 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm22957-201ENSMUST00000122511 123 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm13941-201ENSMUST00000127918 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm23387-201ENSMUST00000158586 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm25365-201ENSMUST00000158852 121 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm17204-201ENSMUST00000167936 478 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Mir3098-201ENSMUST00000175416 87 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm23415-201ENSMUST00000175519 83 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps118-201ENSMUST00000176785 908 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm23287-201ENSMUST00000179427 116 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm23143-201ENSMUST00000180137 116 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm11392-201ENSMUST00000181419 710 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Mir6402-201ENSMUST00000183406 80 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm28058-201ENSMUST00000186421 264 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 4930449A18Rik-202ENSMUST00000192453 1200 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm43675-201ENSMUST00000199468 1184 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Olfr511-ps1-201ENSMUST00000207188 217 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 CT030684.2-201ENSMUST00000228946 826 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 2610044O15Rik8-201ENSMUST00000079272 264 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm24871-201ENSMUST00000083099 116 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm26126-201ENSMUST00000083188 164 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Rnu5g-201ENSMUST00000093721 116 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 AC164297.6-201ENSMUST00000224643 1568 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Olfr722-201ENSMUST00000053290 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm14677-201ENSMUST00000117866 486 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm23328-201ENSMUST00000157418 132 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm22945-201ENSMUST00000158557 157 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Trav5n-3-201ENSMUST00000164511 270 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Mir6950-201ENSMUST00000184438 73 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Mir7079-201ENSMUST00000184697 69 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm27964-201ENSMUST00000185195 62 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm37557-201ENSMUST00000191640 139 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm38316-201ENSMUST00000194838 469 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm19202-201ENSMUST00000198096 808 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm45049-201ENSMUST00000207586 591 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm18598-201ENSMUST00000207724 597 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 AC126267.1-201ENSMUST00000214282 284 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 AC117198.1-201ENSMUST00000217080 651 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Olfr1153-202ENSMUST00000217436 2144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 4930469K13Rik-203ENSMUST00000224226 243 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 mt-Nd2-201ENSMUST00000082396 1038 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm23102-201ENSMUST00000083724 116 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Olfr576-201ENSMUST00000098213 3132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm14406-202ENSMUST00000108945 1348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 mt-Rnr2-201ENSMUST00000082390 1582 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
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