Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm25633-201ENSMUST00000178565 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Ccdc18Q640L5 Gm28710-201ENSMUST00000186866 489 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
Ccdc18Q640L5 Tas2r139-201ENSMUST00000057686 960 ntAPPRIS P1 BASIC1.4□□□□□ -2.19
Ccdc18Q640L5 Zfp600-201ENSMUST00000092750 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
Ccdc18Q640L5 Gm24715-201ENSMUST00000102377 95 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Ccdc18Q640L5 Ighv3-6-201ENSMUST00000103481 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
Ccdc18Q640L5 Gm22561-201ENSMUST00000157331 84 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Ccdc18Q640L5 Gm26414-201ENSMUST00000157674 269 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Ccdc18Q640L5 Gm25375-201ENSMUST00000158157 135 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Ccdc18Q640L5 Mir6393-201ENSMUST00000183709 94 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Ccdc18Q640L5 Gm21139-201ENSMUST00000186594 877 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Ccdc18Q640L5 Gm6109-201ENSMUST00000223297 348 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Ccdc18Q640L5 Gm24555-201ENSMUST00000104548 124 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccdc18Q640L5 Gm14786-201ENSMUST00000117127 944 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccdc18Q640L5 Gm11862-201ENSMUST00000119678 659 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccdc18Q640L5 Mup-ps12-201ENSMUST00000126217 549 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccdc18Q640L5 Gm22862-201ENSMUST00000178593 121 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccdc18Q640L5 Gm15421-201ENSMUST00000051985 443 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccdc18Q640L5 Olfr1098-202ENSMUST00000111574 2885 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccdc18Q640L5 Gm6377-201ENSMUST00000060013 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccdc18Q640L5 Gm22431-201ENSMUST00000158545 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccdc18Q640L5 Olfr192-203ENSMUST00000206214 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccdc18Q640L5 AC158598.2-201ENSMUST00000213397 3832 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccdc18Q640L5 AC211878.4-201ENSMUST00000220970 262 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccdc18Q640L5 AC126554.1-201ENSMUST00000222161 271 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccdc18Q640L5 Gm19118-201ENSMUST00000222554 98 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccdc18Q640L5 Olfr470-201ENSMUST00000073059 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccdc18Q640L5 Olfr1459-201ENSMUST00000078299 1102 ntAPPRIS P1 BASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccdc18Q640L5 Gm7869-201ENSMUST00000121457 1322 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccdc18Q640L5 Gm43484-201ENSMUST00000198333 5966 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccdc18Q640L5 Gm23321-201ENSMUST00000104465 126 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccdc18Q640L5 Rpl30-ps10-201ENSMUST00000117119 347 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccdc18Q640L5 Gm15110-201ENSMUST00000117545 881 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccdc18Q640L5 Gm15113-201ENSMUST00000119280 836 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccdc18Q640L5 Gm15112-201ENSMUST00000120152 860 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccdc18Q640L5 Gm16129-201ENSMUST00000152628 486 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccdc18Q640L5 Vmn1r77-201ENSMUST00000164446 921 ntAPPRIS P2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccdc18Q640L5 Vmn1r-ps53-201ENSMUST00000173066 922 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccdc18Q640L5 Gm7897-201ENSMUST00000193981 554 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccdc18Q640L5 1700072O05Rik-201ENSMUST00000204672 321 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccdc18Q640L5 Skint10-201ENSMUST00000060327 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccdc18Q640L5 Gm13602-201ENSMUST00000122405 493 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccdc18Q640L5 Gm25107-201ENSMUST00000122472 129 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccdc18Q640L5 Gm24467-201ENSMUST00000157887 126 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccdc18Q640L5 Gm6657-203ENSMUST00000188791 531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccdc18Q640L5 Gm5731-201ENSMUST00000190969 481 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccdc18Q640L5 Gm44483-201ENSMUST00000197203 97 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccdc18Q640L5 Gm14008-201ENSMUST00000120483 274 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Ccdc18Q640L5 Gm17521-201ENSMUST00000165345 468 ntAPPRIS P1 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Ccdc18Q640L5 Olfr1458-201ENSMUST00000076729 906 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Ccdc18Q640L5 Gm10778-201ENSMUST00000105315 1497 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccdc18Q640L5 Gm4767-201ENSMUST00000099439 1497 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccdc18Q640L5 Gm23167-201ENSMUST00000157155 103 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccdc18Q640L5 Snord13-201ENSMUST00000157627 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccdc18Q640L5 Gm21737-201ENSMUST00000178112 664 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccdc18Q640L5 Gm21729-201ENSMUST00000180058 664 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccdc18Q640L5 Gm21853-201ENSMUST00000180071 664 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccdc18Q640L5 Gm20901-201ENSMUST00000180177 664 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccdc18Q640L5 Gm5224-201ENSMUST00000183060 350 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccdc18Q640L5 Gm29073-201ENSMUST00000185563 664 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccdc18Q640L5 Gm28453-203ENSMUST00000187041 189 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccdc18Q640L5 1700010N08Rik-201ENSMUST00000187456 189 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccdc18Q640L5 Gm29495-201ENSMUST00000189319 664 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccdc18Q640L5 Gm28090-201ENSMUST00000189458 664 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccdc18Q640L5 Gm21647-201ENSMUST00000189755 664 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccdc18Q640L5 Gm29165-201ENSMUST00000190655 664 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccdc18Q640L5 Gm29211-201ENSMUST00000191470 664 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccdc18Q640L5 Gm36891-201ENSMUST00000191995 655 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Ccdc18Q640L5 Vmn2r-ps80-201ENSMUST00000173697 914 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Ccdc18Q640L5 Mir6383-201ENSMUST00000184545 116 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Ccdc18Q640L5 AC132384.9-201ENSMUST00000218085 277 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Ccdc18Q640L5 AC147256.1-201ENSMUST00000221589 626 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Ccdc18Q640L5 CT010480.1-201ENSMUST00000223612 363 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Ccdc18Q640L5 Gm23735-201ENSMUST00000082551 134 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Ccdc18Q640L5 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Ccdc18Q640L5 Gm6954-201ENSMUST00000117416 225 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Ccdc18Q640L5 Gm14835-201ENSMUST00000119039 315 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Ccdc18Q640L5 Gm11359-201ENSMUST00000120039 567 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Ccdc18Q640L5 Gm22390-201ENSMUST00000157588 325 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Ccdc18Q640L5 Gm23180-201ENSMUST00000158686 125 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Ccdc18Q640L5 1700010K23Rik-201ENSMUST00000174502 376 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
Ccdc18Q640L5 Mir5124a-201ENSMUST00000175528 72 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Ccdc18Q640L5 Gm22583-201ENSMUST00000178031 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Ccdc18Q640L5 Gm45288-201ENSMUST00000210236 151 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Ccdc18Q640L5 Mucl1-201ENSMUST00000078842 621 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Ccdc18Q640L5 Vmn2r-ps118-201ENSMUST00000176785 908 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Ccdc18Q640L5 Gm42774-201ENSMUST00000198854 283 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Ccdc18Q640L5 Gm17990-201ENSMUST00000211728 553 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Ccdc18Q640L5 CT010455.1-201ENSMUST00000218579 413 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Ccdc18Q640L5 Zmynd11-223ENSMUST00000222358 340 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Ccdc18Q640L5 AC134254.4-201ENSMUST00000223086 370 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Ccdc18Q640L5 Gm29550-201ENSMUST00000185543 285 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Ccdc18Q640L5 1700040F17Rik-201ENSMUST00000187158 817 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
Ccdc18Q640L5 AC121569.2-201ENSMUST00000222557 574 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Ccdc18Q640L5 CT025630.1-201ENSMUST00000227901 172 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Ccdc18Q640L5 Vmn1r229-201ENSMUST00000076759 921 ntAPPRIS P1 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Ccdc18Q640L5 Gm23517-201ENSMUST00000082830 192 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Ccdc18Q640L5 Usp46os1-201ENSMUST00000129275 508 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
Ccdc18Q640L5 Gm22559-201ENSMUST00000157329 134 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Ccdc18Q640L5 Spink10-206ENSMUST00000162511 684 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.5 ms