Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 AC122428.1-201ENSMUST00000213709 217 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm34662-201ENSMUST00000220502 215 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Selenok-ps5-201ENSMUST00000221048 278 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 CT025630.1-201ENSMUST00000227901 172 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Olfr339-201ENSMUST00000071437 930 ntAPPRIS P1 BASIC0.97□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Mir322-201ENSMUST00000083484 95 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm25409-201ENSMUST00000083764 131 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1218-202ENSMUST00000213609 3760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm15126-201ENSMUST00000118631 833 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm6664-201ENSMUST00000119138 468 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm6444-201ENSMUST00000119611 458 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm26256-201ENSMUST00000122499 186 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm16354-201ENSMUST00000155376 150 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm26275-201ENSMUST00000157101 268 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm25621-201ENSMUST00000157223 114 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm17196-201ENSMUST00000164074 345 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm4540-201ENSMUST00000170669 429 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Prol1-201ENSMUST00000170832 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Prl3c1-203ENSMUST00000178072 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Obox4-ps39-201ENSMUST00000184306 628 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Mir7028-201ENSMUST00000185016 64 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm37054-201ENSMUST00000193481 543 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm7871-201ENSMUST00000195346 618 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Ighv12-1-201ENSMUST00000195542 329 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm29865-201ENSMUST00000197726 451 ntTSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm44182-201ENSMUST00000204052 115 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm45614-201ENSMUST00000209994 721 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm8940-201ENSMUST00000212585 219 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 AC126672.1-201ENSMUST00000217096 396 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 AC160031.2-201ENSMUST00000218242 274 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Olfr955-201ENSMUST00000073946 945 ntAPPRIS P1 BASIC0.96□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm25810-201ENSMUST00000082752 108 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm23939-201ENSMUST00000082880 133 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm23727-201ENSMUST00000083352 164 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1101-201ENSMUST00000099870 933 ntAPPRIS P1 BASIC0.96□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1450-202ENSMUST00000213587 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r83-202ENSMUST00000226701 2788 ntAPPRIS P1 BASIC0.96□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap5-201ENSMUST00000110725 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm14238-201ENSMUST00000120227 323 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm24908-201ENSMUST00000157294 127 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm23713-201ENSMUST00000157353 70 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm23122-201ENSMUST00000157645 103 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm24858-201ENSMUST00000158058 323 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm22615-201ENSMUST00000158102 70 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm3543-202ENSMUST00000179947 231 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm37576-201ENSMUST00000194228 372 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm43723-201ENSMUST00000196886 189 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm42825-201ENSMUST00000198883 723 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm43897-201ENSMUST00000204019 309 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm44857-201ENSMUST00000208331 196 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm45268-201ENSMUST00000210046 370 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm35262-201ENSMUST00000215133 267 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 AC154552.3-201ENSMUST00000220741 444 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Cenpk-201ENSMUST00000022227 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 CT025538.2-201ENSMUST00000226083 772 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Pmis2-201ENSMUST00000051495 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1459-201ENSMUST00000078299 1102 ntAPPRIS P1 BASIC0.95□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm26493-201ENSMUST00000083155 136 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Mir211-201ENSMUST00000083651 106 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Mir208b-201ENSMUST00000104735 77 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm13728-201ENSMUST00000117471 400 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm14677-201ENSMUST00000117866 486 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Defa-ps8-201ENSMUST00000120972 279 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm11430-201ENSMUST00000121317 217 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s15-201ENSMUST00000122635 111 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm14254-201ENSMUST00000136371 296 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm13274-202ENSMUST00000137624 271 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Mir669n-201ENSMUST00000158636 54 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 4930598A11Rik-201ENSMUST00000180742 628 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Mir6399-201ENSMUST00000184050 84 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 1810022K09Rik-203ENSMUST00000185423 278 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm31230-201ENSMUST00000199725 785 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm43171-201ENSMUST00000199882 291 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm17991-201ENSMUST00000208139 297 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 CT009696.2-201ENSMUST00000216668 432 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm21937-201ENSMUST00000222825 218 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 AC160930.1-201ENSMUST00000227194 337 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Olfr835-201ENSMUST00000059315 936 ntAPPRIS P1 BASIC0.94□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm25853-201ENSMUST00000082793 132 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm44821-201ENSMUST00000208212 2002 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Olfr774-202ENSMUST00000203248 1429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm14918-201ENSMUST00000118153 268 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm23124-201ENSMUST00000157650 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Mir1967-201ENSMUST00000157789 82 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm26089-201ENSMUST00000157898 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps58-201ENSMUST00000174460 840 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm18985-201ENSMUST00000196472 1079 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm42924-201ENSMUST00000197261 185 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm43199-201ENSMUST00000200019 307 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm44459-201ENSMUST00000203926 160 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm7443-201ENSMUST00000206355 378 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Olfr165-203ENSMUST00000206410 1040 ntAPPRIS P2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Olfr581-ps1-201ENSMUST00000209214 556 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 AC117688.1-201ENSMUST00000213142 832 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Olfr941-ps1-201ENSMUST00000215258 935 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Olfr165-201ENSMUST00000052516 1040 ntAPPRIS ALT1 BASIC0.93□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm25683-201ENSMUST00000083940 131 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm45263-201ENSMUST00000210377 1375 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm23431-201ENSMUST00000104006 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm14932-201ENSMUST00000117112 453 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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