Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Serf1-202ENSMUST00000129014 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm2165-205ENSMUST00000155337 397 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm26100-201ENSMUST00000157245 127 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm24138-201ENSMUST00000157572 114 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm25653-201ENSMUST00000158473 138 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps58-201ENSMUST00000173044 242 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm27385-201ENSMUST00000184747 104 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Fam122c-203ENSMUST00000186314 898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm29591-201ENSMUST00000188215 357 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm28072-202ENSMUST00000190486 352 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm38050-201ENSMUST00000191904 238 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm44041-201ENSMUST00000203678 396 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 AL450317.1-201ENSMUST00000213941 291 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 AC171203.1-201ENSMUST00000215363 456 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 AC159232.1-201ENSMUST00000222297 580 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm31025-201ENSMUST00000222553 482 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 AC104832.1-201ENSMUST00000222938 550 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 AC161572.1-201ENSMUST00000227486 640 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Defb19-201ENSMUST00000053180 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm24037-201ENSMUST00000082871 180 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm22364-201ENSMUST00000083097 98 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm23297-201ENSMUST00000083184 127 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm22287-201ENSMUST00000083197 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm23741-201ENSMUST00000097237 171 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 AC152951.2-201ENSMUST00000218293 3587 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm43875-201ENSMUST00000203319 2475 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Pak3-205ENSMUST00000112868 8163 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Ifi203-201ENSMUST00000042228 3754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Ccdc7b-201ENSMUST00000026912 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Vmn1r79-203ENSMUST00000227530 5581 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Trav6-7-dv9-201ENSMUST00000103638 379 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm22656-201ENSMUST00000104199 171 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm14973-201ENSMUST00000117248 255 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm15175-201ENSMUST00000117629 132 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm23791-201ENSMUST00000122553 293 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Clec5a-203ENSMUST00000129948 858 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm13794-201ENSMUST00000148637 468 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm26277-201ENSMUST00000157097 152 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm25909-201ENSMUST00000157619 121 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm24853-201ENSMUST00000158026 121 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps83-201ENSMUST00000172677 705 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Mir5129-201ENSMUST00000174938 78 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm20794-201ENSMUST00000177626 628 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm27374-201ENSMUST00000183660 81 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm28843-201ENSMUST00000189198 678 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm29546-201ENSMUST00000191171 678 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Traj57-202ENSMUST00000196977 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm44353-201ENSMUST00000200618 138 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Olfr1483-ps1-201ENSMUST00000208241 334 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm45402-201ENSMUST00000211796 223 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Olfr822-201ENSMUST00000080460 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm17969-201ENSMUST00000185706 2557 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Vmn1r77-204ENSMUST00000228213 8094 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Olfr803-202ENSMUST00000204641 2385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm24118-201ENSMUST00000103972 126 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm26396-201ENSMUST00000104093 132 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm23175-201ENSMUST00000104371 132 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Sval2-202ENSMUST00000119995 463 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm14736-201ENSMUST00000121470 336 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm11229-201ENSMUST00000121993 437 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm25621-201ENSMUST00000157223 114 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm6788-201ENSMUST00000166459 270 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm17162-201ENSMUST00000168538 473 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Tshb-202ENSMUST00000170856 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm29335-201ENSMUST00000188361 459 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 1700010I02Rik-202ENSMUST00000188525 430 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm28217-201ENSMUST00000188613 648 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm31415-201ENSMUST00000194963 344 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Zfp813-ps-202ENSMUST00000204773 618 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm44472-201ENSMUST00000204922 943 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Olfr505-ps1-201ENSMUST00000207626 976 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm44909-201ENSMUST00000208756 165 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Olfr638-202ENSMUST00000218325 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm33680-201ENSMUST00000219336 576 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Zmynd11-223ENSMUST00000222358 340 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 AC154276.2-201ENSMUST00000227707 309 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm10237-201ENSMUST00000078393 273 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm44601-201ENSMUST00000206678 2720 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Olfr1457-204ENSMUST00000215229 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm42785-201ENSMUST00000202316 3835 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm2026-201ENSMUST00000109007 1621 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Olfr1454-202ENSMUST00000213806 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Olfr592-202ENSMUST00000106893 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm45104-201ENSMUST00000208748 4350 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm14670-201ENSMUST00000117327 337 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 n-R5s216-201ENSMUST00000122755 112 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm25283-201ENSMUST00000157272 77 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm24419-201ENSMUST00000157875 332 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm24730-201ENSMUST00000158228 117 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm23016-201ENSMUST00000158431 62 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm3470-201ENSMUST00000160819 420 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm26195-201ENSMUST00000175035 101 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 4930555M17Rik-201ENSMUST00000176666 402 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Olfr1187-ps1-201ENSMUST00000177576 334 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm24418-201ENSMUST00000177597 79 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm24639-201ENSMUST00000178518 79 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm23076-201ENSMUST00000179082 79 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm25077-201ENSMUST00000179157 79 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm23860-201ENSMUST00000179446 132 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Sh3bp1P55194 Gm28399-201ENSMUST00000186221 318 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
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