Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Gm45459-201ENSMUST00000209882 442 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Prl2c5-201ENSMUST00000021778 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Gm2436-201ENSMUST00000219562 774 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 CT030187.1-201ENSMUST00000220605 252 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Gm19563-201ENSMUST00000222031 270 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Gm25135-201ENSMUST00000082648 143 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Rny3-201ENSMUST00000083011 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Gm23264-201ENSMUST00000083372 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Esp34-201ENSMUST00000173055 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Esp34-202ENSMUST00000178654 1413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Gm37903-201ENSMUST00000192122 2381 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Ogn-201ENSMUST00000021822 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Gm14401-203ENSMUST00000108970 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Gm15175-201ENSMUST00000117629 132 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Gm13541-201ENSMUST00000119519 283 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Gm6806-201ENSMUST00000120092 1006 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Gm15167-201ENSMUST00000121997 187 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Gm15986-201ENSMUST00000122153 400 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Gm16411-201ENSMUST00000122164 1100 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Gm14562-201ENSMUST00000129885 543 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Gm13625-201ENSMUST00000149283 480 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Gm4128-201ENSMUST00000154338 461 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Gm22651-201ENSMUST00000157872 94 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Gm24959-201ENSMUST00000157924 146 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Gm24736-201ENSMUST00000158862 130 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Gm20513-201ENSMUST00000174074 537 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Snord53-201ENSMUST00000175146 78 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Olfr1187-ps1-201ENSMUST00000177576 334 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Gm27786-201ENSMUST00000184337 70 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Gm28494-201ENSMUST00000187687 562 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Gtpbp4-ps6-201ENSMUST00000198160 292 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Olfr278-ps1-201ENSMUST00000205676 238 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Gm33501-202ENSMUST00000209983 706 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Olfr942-ps1-201ENSMUST00000215640 662 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 CAAA01090905.1-201ENSMUST00000219056 426 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 AC159619.2-201ENSMUST00000222924 401 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 AC159188.1-201ENSMUST00000225198 526 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Efcab9-201ENSMUST00000054327 754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Olfr937-201ENSMUST00000055567 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Olfr305-201ENSMUST00000069236 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Gm26446-201ENSMUST00000082455 103 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Mir452-201ENSMUST00000093629 85 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Gm20345-201ENSMUST00000175839 2414 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Gm42445-201ENSMUST00000196996 2893 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Gm45104-201ENSMUST00000208748 4350 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Olfr109-203ENSMUST00000214938 5550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Olfr623-202ENSMUST00000213840 3980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Zfp934-202ENSMUST00000101547 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Olfr896-ps1-203ENSMUST00000216276 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Csn1s2b-202ENSMUST00000101057 1668 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Gm26147-201ENSMUST00000104479 114 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Gm22496-201ENSMUST00000104493 88 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Vmn1r121-201ENSMUST00000105197 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Rpl30-ps10-201ENSMUST00000117119 347 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Rpl30-ps3-201ENSMUST00000117928 348 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Gm12191-201ENSMUST00000118307 348 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Gm9703-201ENSMUST00000119573 343 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Rpl30-ps11-201ENSMUST00000119630 345 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Rpl30-ps1-201ENSMUST00000119767 348 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Gm15807-201ENSMUST00000119880 1128 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Gm11420-201ENSMUST00000120047 402 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Gm14530-201ENSMUST00000122391 333 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Gm21775-201ENSMUST00000178669 540 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Gm25175-201ENSMUST00000178712 79 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Gm8532-201ENSMUST00000179174 461 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Gm9892-201ENSMUST00000182415 992 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Gm28755-201ENSMUST00000185773 199 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Gm29591-201ENSMUST00000188215 357 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 AC153977.1-201ENSMUST00000219416 506 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 AC154262.1-201ENSMUST00000225976 286 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Rpl30-ps8-201ENSMUST00000076166 345 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 AF357341-201ENSMUST00000083088 75 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Gm24045-201ENSMUST00000083113 98 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Gm10343-201ENSMUST00000096279 348 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Olfr1245-202ENSMUST00000217402 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Olfr1354-202ENSMUST00000204587 3781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Olfr1354-203ENSMUST00000217073 3792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Zc3h14-201ENSMUST00000021399 1430 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Olfr1270-204ENSMUST00000215975 4854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Olfr839-ps1-201ENSMUST00000212127 7759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Gm43889-201ENSMUST00000203950 3681 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Olfr1313-202ENSMUST00000213577 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Snord116l9-201ENSMUST00000101891 94 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Gm26504-201ENSMUST00000102033 94 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Sult2a-ps3-201ENSMUST00000117899 428 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Cyp4b1-ps1-201ENSMUST00000118753 315 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Gm12515-201ENSMUST00000120116 361 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Gm15223-201ENSMUST00000120989 826 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Gm25270-201ENSMUST00000122606 138 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Gm13656-201ENSMUST00000123829 345 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Tcrg-C3-201ENSMUST00000164407 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Gm26502-201ENSMUST00000177732 94 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Snord116l13-201ENSMUST00000177737 94 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Gm25350-201ENSMUST00000177849 94 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Snord116l15-201ENSMUST00000177940 94 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Gm23446-201ENSMUST00000177977 94 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Snord116l4-201ENSMUST00000177982 94 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Gm26201-201ENSMUST00000178047 94 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Gm24711-201ENSMUST00000178062 94 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Apobec1P51908 Gm24609-201ENSMUST00000178166 94 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.1 ms